防治菌核病的办法是防和治并重，防治和药物防治并举。 病地实行轮作，或进行土壤消毒，用40%五氯硝基苯，每667m2用量1kg，加细土50kg，拌匀后施入土壤中。选用无病种子从无病株上留种。对混有菌核的种子，可用10％盐水漂洗种子，淘除菌核。然后用清水反复冲洗种子，晾干后播种。也可以用温水50℃浸种10分钟(保持温度)，可杀死混在种子中的菌核。扣棚后喷施1000倍“菌核净”1次，10天后再喷1次，立春前后喷第3次，以后每7～9天喷1次。防治，整个生长期要加强放风，降低湿度以减轻病害发生。