由于大蒜根腐病是一种土传病害，因此，防治大蒜根腐病要以预防为主，目前防治大蒜根腐病最简单，最有效的方法就是药剂拌种，可在大蒜播种前，每亩用41%唑醚·甲菌灵悬浮种衣剂150～450毫升，拌大蒜种子150公斤，将种衣剂均匀包裹在种子表面，可有效阻止病菌的侵入。