药剂防治。在发病初期用农用链霉素、噻菌铜等药剂淋根、泼浇或者喷雾。田间发病流行期，每隔5-7天用药一次，连续喷药2-3次。

2、农业防治：(1)选用地势高、排灌方便、地下水位低、通透性好的地块种植。(2)选用抗性品种。通过引种示范试验，因地制宜推广和换栽抗(耐)甘薯茎腐病品种；(3)加强田间管理。培育无病壮秧，少施氮肥，适当增施磷钾肥，补施微量元素，提高植株抗病能力。采取高畦栽培方式，防止田间积水，避免漫灌导致交叉感染。(4)合理轮作倒茬。通过改变耕作方式，与甘薯茎腐病非寄主作物进行轮作，减少病源。

防控技术 1、检疫监管：加强种薯、薯苗的产地检疫，严格按照《甘薯种苗产地检疫规程》要求，严禁病田种薯留作种用。强化调运检疫，防止通过种薯、薯苗进行传播扩散。对从外地调入的种薯、薯苗，必须附有《植物检疫证书》，确保不带此类病菌，并对种植区加强病害监测，一旦发现疫情，及时向植物检疫机构报告。对新发生的零星疫点，就地集中清理销毁发病植株，并用生石灰对发病点土壤进行消毒处理。

药剂浸种。播种和扦插前用农用链霉素或噻菌铜浸泡种薯和薯苗杀菌；

传播途径 甘薯茎腐病可以在病薯、病蔓、病薯周围的土壤和其他寄主中存活，成为初侵染源。病原菌可通过种薯、薯苗调运作远距离传播。在病区，茎腐病还可通过感病植株、田间灌溉水、工具、工作鞋粘附病土等途径进行传播。